同一臺(tái)質(zhì)譜儀可以配幾種不同的離子源如電子轟擊電離源（EI）和化學(xué)電離源（CI）。通常GC-MS氣質(zhì)聯(lián)用儀會(huì)配電子轟擊電離源（EI）和化學(xué)電離源（CI），樣品在離子源中電離成離子，比較常用的離子源有與GC串聯(lián)的電子轟擊電離源（EI）和化學(xué)電離源（CI），與LC串聯(lián)質(zhì)譜常用電噴霧離子化(ESI)、大氣壓化學(xué)電離(APCI)、大氣壓光電離(APPI)，以及基質(zhì)輔助光解吸離子化（MALDI）等等。

電離方式和離子源

電轟擊電離（EI）：一定能量的電子直接作用于樣品分子，使其電離，且效率高，有助于質(zhì)譜儀獲得高靈敏度和高分辨率。有機(jī)化合物電離能為10eV左右，50-100eV時(shí)，大多數(shù)分子電離界面最大。70eV能量時(shí)，得到豐富的指紋圖譜，靈敏度接近最大。適當(dāng)降低電離能，可得到較強(qiáng)的分子離子信號(hào)，某些情況有助于定性。

化學(xué)電離（CI）：電子轟擊的缺陷是分子離子信號(hào)變得很弱，甚至檢測(cè)不到。化學(xué)電離引入大量試劑氣，使樣品分子與電離離子不直接作用，利用活性反應(yīng)離子實(shí)現(xiàn)電離，其反應(yīng)熱效應(yīng)可能較低，使分子離子的碎裂少于電子轟擊電離。商用質(zhì)譜儀一般采用組合EI/CI離子源。試劑氣一般采用甲烷氣，也有N2,CO,Ar或混合氣等。試劑氣的分壓不同會(huì)使反應(yīng)離子的強(qiáng)度發(fā)生變化，所以一般源壓為0.5-1.0Torr。

大氣壓化學(xué)電離（APCI）：在大氣壓下，化學(xué)電離反應(yīng)速率更大，效率更高，能夠產(chǎn)生豐富的離子。通過(guò)一定手段將大氣壓力下產(chǎn)生的離子轉(zhuǎn)移至高真空處（質(zhì)量分析器中）。早期為Ni63輻射電離離子源，另一種設(shè)計(jì)是電暈放電電離，允許載氣流速達(dá)9L/S。需要采取減少源壁吸附和溶劑分子干擾。

二次離子質(zhì)譜（FAB/LSIMS）：在材料分析上，人們利用高能量初級(jí)粒子轟擊表面（涂有樣品的金屬鈀），再對(duì)由此產(chǎn)生的二次離子進(jìn)行質(zhì)譜分析。主要有快原子轟擊（FAB）和液體二次離子質(zhì)譜（LSIMS）兩種電離技術(shù),分別采用原子束和離子束作為高能量初級(jí)粒子。一般采用液體基質(zhì)負(fù)載樣品（如甘油、硫甘油、間硝基芐醇、二乙醇胺、三乙醇胺或一定比例混合基質(zhì)等）。主要原理是分子質(zhì)子化形成MH+離子，其中有些反應(yīng)會(huì)形成干擾。

等離子解析質(zhì)譜（PDMS）：采用放射性同位素（如Cf252）的核裂變碎片作為初級(jí)粒子轟擊樣品，將金屬箔（鋁或鎳）涂上樣品從背面轟擊，傳遞能量使樣品解析電離。電離能大大高于FAB/LSIMS，可分析多肽和蛋白質(zhì)。

激光解吸/電離（MALDI）：波長(zhǎng)為1250-775的真空紫外光輻射產(chǎn)生光致電離和解吸作用，獲得分子離子和有結(jié)構(gòu)信息的碎片，適于結(jié)構(gòu)復(fù)雜、不易氣化的大分子，并引入輔助基質(zhì)減少過(guò)分碎裂。一般采用固體基質(zhì)，基質(zhì)樣品比為10000/1。根據(jù)分析目的不同使用不同的基質(zhì)和波長(zhǎng)。

采用EI則比較困難對(duì)其進(jìn)行較為準(zhǔn)確的定性，此時(shí)就需要用到CI源這種軟電離的離子化方式，通過(guò)獲得分子離子信息進(jìn)而推斷化合物的結(jié)構(gòu)，對(duì)定性非常有用，此外一些化合物采用CI分析可以獲得更高靈敏度。

CI源離子化室的氣密性比EI源好，以保證通入離子源的反應(yīng)時(shí)間有足夠壓力。

一個(gè)是電子源，一個(gè)是化學(xué)源，針對(duì)的分子量不同，CI分析的分子量會(huì)大一些，當(dāng)然兩個(gè)源分析的原理也不同！兩種的電離方式不同。EI源是電子轟擊使樣品帶電，結(jié)構(gòu)會(huì)打得比較碎。CI是通過(guò)反應(yīng)氣與樣品發(fā)生反應(yīng)從而電離，一般分子離子保留得比較好。

EI源主要由電離室（離子盒）、燈絲、離子聚焦透鏡和一對(duì)磁極組成。燈絲發(fā)射電子，經(jīng)聚焦并在磁場(chǎng)作用下穿過(guò)離子余弦定理到達(dá)收集極。此時(shí)進(jìn)入離子化室的樣品分子在一定能量電子的作用下發(fā)生電離，離子被聚焦、加速聚焦成離子束進(jìn)入質(zhì)量分析器。

CI離子源的結(jié)構(gòu)和EI源相似，也是由電離室（離子盒）、燈絲、離子聚焦透鏡和一對(duì)磁極組成。主要區(qū)別是離子化室的氣密性比EI源好，以保證通入離子源的反應(yīng)時(shí)間有足夠壓力。

CI和EI一樣，燈絲發(fā)射的電子使中性分子電離，不同的是樣品和反應(yīng)試劑一起進(jìn)入離子化室，反應(yīng)所濃度高于樣品濃度，首先電離的是反應(yīng)試劑中性分子，由于壓力較高，發(fā)生離子-分子反應(yīng)，產(chǎn)生各種活性反應(yīng)離子，這些離子與樣品分子再發(fā)生離子-分子反應(yīng)，實(shí)現(xiàn)樣品分子電離。常用的反應(yīng)氣試劑有甲烷、異丁烷、氨氣等。

相對(duì)于EI源來(lái)說(shuō)，CI源需要額外的甲烷、異丁烷等反應(yīng)劑氣體在離子源內(nèi)電離，與目標(biāo)化合物發(fā)生分子-離子反應(yīng)，傳統(tǒng)的離子源都是獨(dú)立的EI源和CI源，需要更換離子化模式時(shí)就需要卸除真空進(jìn)行硬件的更換，更換過(guò)程以及真空系統(tǒng)的穩(wěn)定需要很長(zhǎng)的時(shí)間，這就給實(shí)驗(yàn)工作帶來(lái)非常大的不便，雙源EI/CI復(fù)合離子源，保證EI源靈敏度不受影響的前提下輕松實(shí)現(xiàn)一個(gè)離子源EI和CI兩種離子化模式無(wú)縫切換，滿足客戶在不同領(lǐng)域的定性分析和定量分析。

節(jié)約大量時(shí)間，提升實(shí)驗(yàn)效率：離子化模式切換時(shí)無(wú)需卸真空，無(wú)需換離子源,

基于分子量的相似度檢索，加強(qiáng)鑒定結(jié)果準(zhǔn)確性 ：通過(guò)CI模式獲得分子離子峰確定目標(biāo)化合物分子量，再通過(guò)比對(duì)EI模式獲得相似度檢索的定性結(jié)果加強(qiáng)鑒定的準(zhǔn)確性。

保證高靈敏度，與獨(dú)立離子源具有相同的定性定量效果